iMed қолданбалары Web Қолданбаның пайдаланушы нұсқаулығы

iMed пайдаланушы нұсқаулығы

Кіріспе

1.1. Мақсат
Мұның мақсаты web Қолданба шикі ақпаратты қабылдау және оны шешім қабылдауда пайдалы нәтижелер беретін етіп өңдеуге мүмкіндік беру болып табылады. Бұл өңделмеген деректермен үлгіні үйрету немесе үлгілер мен талдау арқылы нәтижені болжау болуы мүмкін.
1.2. Навигациялық мәзір
Беттің жоғарғы жағындағы шарлау мәзірі сізге қажет жерге жету үшін барлық сілтемелерді қамтиды. Егер сіз адасып қалсаңыз, таныс бетке өту, үйге оралу немесе навигациялық мәзірден іздеген бетті табу үшін әрқашан артқа көрсеткіні баса аласыз.
1.3. Есептік жазба
Егер сізде тіркелгіңіз болмаса, қолданбаны пайдалану үшін тіркелуіңіз керек. Ол үшін жоғарғы оң жақтағы тіркелгі түймесін басып, тіркелу түймесін басыңыз. Содан кейін жалғастыру үшін пайдаланушы атыңызды, құпия сөзіңізді және электрондық поштаңызды енгізіңіз.

Егер сізде бұрыннан тіркелгі болса, пайдаланушы аты мен құпия сөзбен кіріңіз.

Негізгі бет

Беттің сол жағындағы элементтерді басу арқылы әрқайсысының не істейтінін түсінуге көмектесу үшін беттің ортасында әрқайсысының сипаттамасы пайда болады.

iMedBot

IMedBot қолданбасы пайдаланушының агенттермен оңай әрекеттесуіне ықпал ететін интерфейсті ұсынады, бұл жеке болжау мен үлгіні оқытуға мүмкіндік береді. Бұл терең оқытуды зерттеу нәтижелерін осы доменде қосымша зерттеулерді бастауға әлеуеті бар онлайн құралға айналдырудың алғашқы қадамы болып табылады. Оның сәйкес пайдаланушы нұсқаулығын мына жерден табуға болады.

Деректерді талдау

4.1. Ішкі жиындарды шығарып алу
Бұл бөлім пайдаланушыға деректер жинағын өңдеуге мүмкіндік береді. Жаңа деректер жинағын жүктеп салуды немесе ашылмалы мәзірден барын пайдалануды таңдауға болады.

Деректер жинағы жүктеп салынғаннан кейін, сол жақ мәзірдегі опциялардың бірін басу арқылы қандай әрекетті орындағыңыз келетінін таңдауға болады.
4.1.1. Сүзгілерге негізделген ішкі жиындарды шығарып алу
Бұл бөлім берілген сүзгілерге негізделген бастапқы деректер жиынының кішірек жиынын алуға мүмкіндік береді. Ішкі жиында қажет мәндерді таңдаңыз, содан кейін соңғы деректер жиынында көрсетілетін бағандарды таңдаңыз.

4.1.2. Сұрыпталған нәтижелерді қайтарыңыз
Бұл деректер жиынын сұрыпталған пішінде қайтарады. Мақсатты бағанды, сұрыптау ретін, қайтарылатын жолдар санын және соңғы нәтижеде көрсетілетін бағандарды таңдаңыз.

4.1.3. Деректер жиынын кеңейтіңіз
Бұл пайдаланушыға сөздік ретінде сақталған жеке бағанды ​​пайдаланушы өңдеуге болатын нақты кестеге кеңейтуге мүмкіндік береді. Ол кірістірілген деректер жинағын алады және пайдаланушы талап ететін нәрсені ең жоғарғы деңгейге жылжытады. Алдымен кірістірілген деректер жиыны бар бағанды ​​қамтитын деректер жинағын жүктеп салыңыз. Кеңейтуді қажет ететін баған автоматты түрде анықталса, қай бағанды ​​кеңейту керектігін және кірістірілген ақпараттан қай бағандарды шығару керектігін таңдаңыз. Жіберу түймесін басыңыз және сіз жасай аласыз view ақпаратыңызды кірістірілген деректердің орнына кестенің бағандары ретінде көрсетіңіз.
4.2. Біріктіру Files
Ctrl пернесін басу арқылы бірнеше деректер жиынын таңдау және жүктеп салу (mac үшін пәрмен), бұл оларды басқа нәрсе үшін пайдаланылғаннан гөрі үлкенірек бір деректер жиынына біріктіреді.

Тек барлық деректер жиынын таңдап, қажетті ақпаратты толтырыңыз. Бұл жаңа деректер жинағын iMed қолданбасына сақтайды және содан кейін жүктеп алуға болады.
4.3. Сюжеттік функциялар
Бұл бөлім пайдаланушыға деректер жиынын салуға мүмкіндік береді. Сол жақтағы мәзірден опциялардың бірін таңдап, сюжетті алу үшін қажетті өрістерді толтырыңыз. Төменде деректеріңізден жасауға болатын сюжеттер түрлері берілген:

4.4. Статистикалық талдау
Бұл бөлім деректер жиынында статистикалық сынақтарды жүргізуге мүмкіндік береді. Сол жақтағы мәзірден іске қосу үшін сынақты таңдаңыз және сынақтарды орындау үшін өрістерді толтырыңыз. Төменде қол жетімді сынақ түрлері берілген:

ODPAC

5.1. Үйрену
Бұл бетте осы бетте қолжетімді ресурстың әрбір түрінің қысқаша сипаттамасы бар. Әрбір бөлімнің жоғарғы жағындағы түймені басу пайдаланушыға тақырып туралы көбірек білуге ​​немесе пайдалануға мүмкіндік беретін басқа бетке сілтеме жасайды.
5.1.1. Эпистаз
Бұл бетте деректерден үйрену үшін іздеу алгоритмі MBS пайдалануға мүмкіндік береді. Нақтырақ айтқанда, эпистазды, фенотипке әсер ететін екі немесе одан да көп гендердің өзара әрекеттесуін зерттеуге мүмкіндік береді. Бұл кәсіпқойлар үшін пайдалыfile генетикалық аспектідегі аурулар. Дәстүрлі әдістер геномдық қауымдастық зерттеулерінде (GWAS) табылған жоғары өлшемді деректерді өңдеуге жарамайды. Multiple Beam Search (MBS) алгоритмі өзара әрекеттесетін гендерді әлдеқайда жылдамырақ анықтауға мүмкіндік береді. Пайдаланғыңыз келетін деректерді жүктеп салыңыз, содан кейін қажетті өрістерді енгізіңіз. Толығырақ ақпарат алу үшін толық қағазды мына жерден табыңыз.

5.1.2. Тәуекел факторлары
Бұл бет деректер арасындағы өзара әрекеттесуді білу үшін IGain бумасын пайдалануға мүмкіндік береді. Ол эвристикалық іздеу арқылы жоғары өлшемді деректерден өзара әрекеттесулерді арнайы үйренеді. Бұл әдіс төменгі өлшемді деректерден өзара әрекеттесулерді үйрену үшін бұрын әзірленген Exhaustive_IGain әдісіне негізделген. Деректерді жүктеп салыңыз, содан кейін қажетті өрістерді енгізіңіз. IS шектері және iGain туралы қосымша ақпаратты мына жерден табуға болады.

5.1.3. Болжау модельдері
Бұл бөлім оны пайдалануды жылдамдату үшін машиналық оқыту үлгілерінің үстіне алдын ала жасалған болжау үлгілерін пайдалануға мүмкіндік береді. Бұл оларды кодтауды пайдаланбай және өздерінің деректер жиынын пайдаланып үлгілерді болжау үшін алдыңғы тәжірибені пайдаланбай пайдалануға мүмкіндік береді. Логистика, регрессия, қолдау векторлық машиналары (SVMs), шешім ағаштары және т.б. қоса алғанда, пайдаланушыға қол жетімді көптеген болжау үлгілері бар. Болжау әдістерінің толық тізімі осы жерде беттің оң жағында орналасқан.
5.2. Болжам
Бұл бөлім бұрын жүктеп салынған ортақ үлгідегі болжамдарға мүмкіндік береді. Алдымен ортақ үлгіні жүктеп салыңыз, егер ол әлі жасалмаса. Содан кейін үлгі атауын басу арқылы болжау үшін пайдаланылатын үлгіні таңдаңыз. Содан кейін пайдалану үшін болжау үлгісі үшін деректерді жүктеп салыңыз. Мұны беттің төменгі жағындағы пішінді немесе жүктеп алуға болатын үлгіні пайдалану арқылы қолмен жасауға болады. Үлгіні пайдалансаңыз, деректер жинағын жүктеп салыңыз file және үлгі болжамын алу үшін жіберу түймесін басыңыз.
5.3. Шешім қабылдауды қолдау
Шешім қабылдауды қолдау классификацияны қамтамасыз етеді және жүйеге берілген ақпараттан емдеу таңдауларына басшылық ете алады. Ол пациенттің ерекшеліктеріне негізделген оңтайлы емдеу процедурасын ұсыну үшін деректер негізінде оқытылды. Клиникалық шешімдерді қолдау жүйелері (CDSS) туралы қосымша ақпаратты мына жерден табуға болады.
Жүйелік ұсыныс пациенттің ерекшеліктерін ескереді және емдеу процедурасын ұсынады және 5 жылдық метастаздың болашақ ықтималдығын болжайды. Пайдаланушы араласуы оңтайлы емнің орнына ағымдағы емге негізделген 5 жылдық метастаздың болашақ ықтималдығын болжау үшін емделуші мүмкіндіктерін де, емдеу процедурасын да алады.

MBIL

Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) – пациенттің нәтижесіне тікелей әсер ететін жалғыз және интерактивті қауіп факторларын үйренетін алгоритм. Мұнда орналасқан MBIL бумасы үшін Python пакетінің индексіне (PyPI) қайта бағытталу үшін «MBIL-ге өту» түймесін басыңыз. MBIL туралы қосымша ақпаратты BMC Bioinformatics сайтынан табуға болады.

Деректер жиындары

Бұл бөлім пайдаланушыға жаңа деректер жиынын көруге және жүктеуге мүмкіндік береді web қолданба.
7.1. Барлық деректер жиынын қолжетімді қараңыз
Барлық қолжетімді деректер жиынын көру үшін жай ғана «Қолжетімді деректер жиынын көрсету» түймесін басыңыз.

7.2. Деректер жиынын жүктеп салу
Деректер жинағын жүктеп салу үшін «Деректер жиынын бөлісу» түймесін басып, содан кейін құжатта көрсетілгендей қажетті ақпаратты толтырыңыз. webбет. Алдымен деректер жинағын жүктеп салыңыз және қажетті өрістерді толтырыңыз.

Содан кейін төмендегі өрістерді толтырыңыз немесе мәтінді жүктеңіз file толтырылған ақпаратпен. БұрынғыampҚолданба оны түсінуі үшін ақпаратты қалай ұйымдастыру керектігі төменде келтірілген.

Модельдер

Бұл бөлім пайдаланушыға қол жетімді үлгілерді көруге және үлгіні ортақ пайдалануға мүмкіндік береді.
8.1. Барлық қол жетімді үлгілерді қараңыз
Барлық қол жетімді үлгілерді көру үшін «Қолжетімді үлгілерді көрсету» түймесін басыңыз.

8.2. Үлгіні бөлісіңіз
Үлгіні ортақ пайдалану үшін «Үлгілеріңізді бөлісу» түймесін басып, үлгіні жүктеп салыңыз file тензорлық ағын немесе PyTorch арқылы оқытылады.

8.2.1. Қатысты деректер жинағы
Содан кейін тақырыптарды қамтитын қатысты деректер жинағын жүктеп салуыңыз керек. Деректер жиынына арналған сынып/белгі соңғы бағанда болуы керек.

8.2.2. Болжамдар және сынып туралы ақпарат
Деректер жиыны барлық мүмкіндіктерді қамтыса, деректер жиынын жүктеп салғаннан кейін мүмкіндік пішінін өткізіп жіберуге болады. Дегенмен, олардың барлығы қамтылмаған болса, бұл ақпарат сипаттамада көрсетілуі керек file немесе мүмкіндік пішінінде. Болжауыштарды және сынып ақпаратын беруді қалайтыныңызды көрсететін ашылмалы тізімнен опцияны таңдаңыз.

Сипаттама опциясын пайдалансаңыз, өрістерді толтыруға немесе мәтінді жүктеп салуға болады file толтырылған ақпаратпен. Бұрынғыampақпаратты қалай ұйымдастыру керектігі төменде берілген.